导出数据

可以将数据列表组合在一起,以便从 EDC“临床报告”的导出(Export)区域导出为导出定义。对于每个导出定义,他们可以从研究中添加一个或多个数据列表。生成导出数据包时,可以选择以 CSV 或 SAS(sas7bdat)格式生成。请注意,CSV 和 SAS 文件采用 UTF-8 编码。建议在 Excel™ 之类的程序中查看这些文件时将编码设置为 UTF-8。

在你选择所需的格式后,“临床报告”会生成一组文件,每个导出列表对应一个文件。生成导出数据包后,你或任何其他有权访问研究 的“临床报告”用户可以下载导出数据包(一个包含列表文件集合的 ZIP 文件(CSV 或 sas7bdat),以及描述数据包内容的清单“manifest.json”)。然后,你可以与研究利益相关者(例如监管机构、医疗监察员和统计学家)共享。你还可以将数据集从 EDC 工具(EDC Tools)中的研究数据提取作业发送到“临床报告”

先决条件

你可以根据系统生成的“核心列表”导出数据,但如果要从自定义列表格式导出数据,则必须首先创建列表。


默认情况下,具有标准 CDMS Lead Data Manager(CDMS 首席数据管理员)和 CDMS Data Manager(CDMS 数据管理员)研究角色的用户能够执行下述操作。如果你的组织使用自定义角色,则你的角色必须授予以下权限:

类型 权限标签 控制
功能权限
功能权限 查看病例手册

能够查看关于和来自受试者病例手册(Casebooks)的信息(针对报告、信息板和 CDB)

功能权限 查看导出

能够访问“导出”页面

功能权限 创建导出定义

能够创建和复制“导出定义”

功能权限 生成导出数据包

能够生成 CSV 或 SAS 导出数据包

功能权限 删除导出定义

能够删除“导出定义”

功能权限 查看导出数据包

能够访问“导出>数据包”以查看生成的导出数据包

如果你的“研究”包含受限数据,你必须具有“受限数据访问”权限才能查看该数据。

了解有关“研究角色”的更多信息。


访问导出

可以从 EDC“临床报告”的导出区域访问导出定义。可以从导航抽屉(Navigation Drawer)研究(Study)菜单导航到导出区域。

导航抽屉中的“导出” “研究”菜单中的“导出”

查看导出

导出页面有两个选项卡: 定义(Definitions) 数据包(Packages)。从导出> 定义中,可以查看、创建和编辑研究导出定义。从导出> 数据包中,可以查看所有生成的导出数据包,并查看错误日志中是否有任何失败。

定义

“临床报告”在导出 > 定义中列出了研究的所有导出定义。下表详细介绍了导出定义 列表的每一列:

描述
名称 导出定义的标题,在定义创建期间定义。如果此定义设置了计划导出,“临床报告”会在此列中显示时钟图标()。将鼠标悬停在图标上以显示计划。
状态 导出定义可以处于以下两种状态之一:草稿已发布
列表 导出定义 中的数据列表数。
类型 导出定义 的类型。有关详细信息,请参见下面的导出类型
创建日期 导出定义创建的日期和时间以及创建该定义的用户的名称。
上次修改时间 上次修改导出定义 的日期和时间以及进行更改的用户的名称。
最新数据包 导出数据包的状态以及生成数据包的日期和时间。单击下载(Download))下载数据包。

可以按最新数据包(Latest Package)修改者(Modified By)修改日期(Modified Date)名称(Name)对此列表进行排序。从排序依据(Sort By)菜单中选择排序列和顺序。

“排序依据(Sort By)”菜单

单击排序方式(Sort By)菜单中的重置(Reset)以返回到默认排序顺序(降序(Descending)、修改日期。

数据包

“临床报告”在导出(Export)> 数据包中列出了为研究 生成的所有数据包。下表列出了数据包列表每列的详细信息:

描述
名称 此列中列出了用于生成数据包的导出定义标题、生成数据包的日期时间 以及数据包中包含的列表数量。如果此数据包设置了计划导出,“临床报告”会在此列中显示时钟图标()。将鼠标悬停在图标上以显示运行的计划。
作业 ID 此列显示导出作业的唯一标识符。
类型 此列中列出了用于生成数据包的导出定义类型
处理者 启动数据包生成的用户的名称以及他们执行此操作的日期时间
开始日期/时间 此列显示导出过程启动的日期和时间。
文件计数 此列表示数据包中的文件总数。
状态 此列中列出了数据包的状态:进行中完成错误完成 后,单击下载)下载数据包。

对数据包进行排序

可以按名称处理者(Processed By)处理日期(Process Date)处理状态(Process Status)对此列表进行排序。从排序依据(Sort By)菜单中选择排序列和顺序。

“排序依据(Sort By)”菜单

单击排序方式(Sort By)菜单中的重置以返回到默认排序顺序(降序(Descending)、处理日期(Process Date))。

错误

如果数据包生成失败,可以从导出> 数据包中查看错误列表。

要查看错误,请执行以下操作:

  1. 导航到研究导出> 数据包
  2. 在列表中找到失败的数据包。
  3. 单击查看问题日志(View Issue Log))。 查看问题日志

  4. “临床报告”将打开问题(Issues)面板。这将列出在数据包生成过程中发生的每个错误。
  5. 可选:单击下载)下载问题日志。
  6. 单击关闭(Close))关闭问题面板。

导出类型

“临床报告”支持两种导出类型:自定义和原始(在 25R1 版本中,SDTM 已弃用)。默认值为自定义(Custom),该类型允许创建自己的导出定义,而没有原始类型中包含的定义约定。

自定义

创建导出定义 时,通过选择自定义作为类型(Type),可以选择不使用原始(Raw)格式。如果你不使用定义的格式,CDB 只会包含你在配置定义时定义的列表和数据。

原始

创建导出定义 时,可以选择使用“原始”格式(通过选择原始 作为类型)。原始导出数据包具有以下特征:

  • 该数据包中包含研究中每个核心列表的导出列表,即使表单没有数据也是如此。
  • 任何日期和日期时间条目都会同时显示默认格式和 RawDate() 格式。有关 RawDate() 格式日期的示例,请参见下面的表。
  • 带有单位的条目包括已转换名称和单位值的列。有关单位列的示例,请参见下面的表。
  • 该数据包中包含用于上下文标题信息的其他系统列表。请参见下面的详细列表。

导出表单列表

除了表单 上的每个条目 的列外,原始导出中的每个表单列表还将包括以下列:

  • Study.Name
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.SeqNbr
  • Event.Name
  • Event.Date
  • Event.VisitMethod
  • Event.Status
  • Form.Name
  • Form.DataSource
  • Form.SeqNbr
  • Form.LastModifiedDate
  • ItemGroup.SeqNbr

系统列表

默认情况下,原始导出类型包括以下系统列表。这些列表为研究提供操作元数据。对于自定义(Custom)导出类型,默认不包括系统列表,但可以根据需要添加。

下表列出了每个系统列表 中包含的列。

系统列表 CQL
Sys_Sites CALL Sys_Sites
  • Study.Name
  • Site.Country
  • Site.Number
  • 研究中心名称
  • Site.PI
  • 研究中心 ID
Sys_Subjects CALL Sys_Subjects
  • Study.Name
  • Site.Country
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • Subject.Status
  • Subject.ID
Sys_Events CALL Sys_Events
  • Study.Name
  • Study.Label
  • Site.CountryName
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • EventGroup.Label
  • EventGroup.RepeatLabel *
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.ExternalID
  • Event.Label
  • Event.Name
  • Event.ExternalID
  • Event.Date
  • Event.VisitMethod
  • Event.PlannedDate
  • EventGroup.SeqNbr
  • Event.EventDateLastModifiedDate
  • Casebook.Version
  • Event.Status
  • Event.ChangeReason
  • Event.WindowStatus
  • Event.DaysOutsideWindow
  • Event.ExpectedForms
  • Event.FormEntryOverdue
  • Event.Frozen
  • Event.FrozenDate
  • Event.Locked
  • Event.LockedDate
  • Event.Signed
  • Event.SignedDate
  • Event.ID

* 只有启用了增量摄取的研究才提供该属性。如果没有为研究配置覆盖标签,则 CQL 将返回事件组标签和序列号。

Sys_Forms CALL Sys_Forms
  • Study.Name
  • Study.Label
  • Site.Country
  • Site.CountryName
  • Site.Number
  • 研究中心名称
  • Site.PI
  • Subject.Name
  • Subject.Status
  • EventGroup.Label
  • EventGroup.RepeatLabel *
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.ExternalID
  • Event.Label
  • Event.Name
  • Event.ExternalID
  • Event.Date
  • Event.Status
  • EventGroup.SeqNbr
  • Form.Label
  • Form.Name
  • Form.ExternalID
  • Form.SeqNbr
  • Form.Status
  • Form.CreatedDate
  • Form.FirstSubmissionDate
  • Form.SubmissionDate
  • Form.SubmissionCount
  • Form.SDVOverridePlan
  • Form.SDV
  • Form.SDVCompleted
  • Form.SDVDate
  • Form.FirstSDVDate
  • Form.SDVLastModifiedDate
  • Form.SubmitToSDV
  • Form.DMROverridePlan
  • Form.DMR
  • Form.DMRCompleted
  • Form.DMRDate
  • Form.FirstDMRDate
  • Form.DMRLastModifiedDate
  • Form.SubmitToDMR
  • Form.Frozen
  • Form.FrozenDate
  • Form.SubmitToFrozen
  • Form.Locked
  • Form.LockedDate
  • Form.SubmitToLocked
  • Form.Signed
  • Form.SignatureDate
  • Form.SubmitToSign
  • Form.ILB
  • Form.ILBReason
  • Form.LastModifiedDate
  • Form.Version
  • Form.ID

* 只有启用了增量摄取的研究才提供该属性。如果没有为研究配置覆盖标签,则 CQL 将返回事件组标签和序列号。

Sys_ILB CALL Sys_ILB
  • Study.Name
  • Study.Label
  • Site.CountryName
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • EventGroup.Label
  • EventGroup.RepeatLabel *
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.ExternalID
  • Event.Label
  • Event.Name
  • Event.ExternalID
  • EventGroup.SeqNbr
  • Form.Label
  • Form.Name
  • Form.ExternalID
  • Form.SeqNbr
  • ItemGroup.Label
  • ItemGroup.Name
  • ItemGroup.ExternalID
  • ItemGroup.SeqNbr
  • Item.Label
  • Item.Name
  • Item.ExternalID
  • LABANALYTENAME
  • ILB Reason

* 只有启用了增量摄取的研究才提供该属性。如果没有为研究配置覆盖标签,则 CQL 将返回事件组标签和序列号。

Sys_Links CALL Sys_Links
  • Study.Name
  • Site.Country
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.SeqNbr
  • Event.Name
  • Form.Name
  • Form.SeqNbr
  • Form.LinkCreatedDate
  • Form.LinkID
  • ItemGroup.Name
  • ItemGroup.SeqNbr
  • FormLink.Name
  • Form.ID
Sys_PD CALL Sys_PD
  • Study.Name
  • Site.CountryName
  • Site.Number
  • Subject.Name
  • PD.ID
  • PD.Summary
  • PD.DeviationDate
  • PD.IdentifiedDate
  • PD.CategoryName
  • PD.CategoryLabel
  • PD.SubcategoryName
  • PD.SubcategoryLabel
  • PD.SeverityName
  • PD.SeverityLabel
  • PD.Description
  • PD.Status
  • PD.Resolution
  • PD.Rule
  • EventGroup.Label
  • EventGroup.RepeatLabel *
  • EventGroup.Name
  • EventGroup.ExternalID
  • Event.Label
  • Event.Name
  • Event.ExternalID
  • Event.SeqNbr
  • Form.Label
  • Form.Name
  • Form.ExternalID
  • Form.SeqNbr
  • ItemGroup.Label
  • ItemGroup.Name
  • ItemGroup.ExternalID
  • ItemGroup.SeqNbr
  • Item.Label
  • Item.Name
  • Item.ExternalID
  • PD.CreatedDate
  • PD.CreatedBy
  • PD.LastModifiedBy
  • PD.UserModifiedDate
  • PD.UserModifiedBy
  • PD.ChangeReason
  • PD.InactivatedBySystem
  • PD.LastInactivatedDate
  • PD.PDID

* 只有启用了增量摄取的研究才提供该属性。如果没有为研究配置覆盖标签,则 CQL 将返回事件组标签和序列号。

核心列表

以下各列包含在配置了实验室或临床编码的核心列表中。

WHODrug 词典列的编码:

  • 编码状态
  • 词典版本
  • 药物 CD
  • 药物名称
  • 首选 CD
  • 首选名称
  • ATC4CD
  • ATC4
  • ATC3CD
  • ATC3
  • ATC2CD
  • ATC2
  • ATC1CD
  • ATC1
  • 上次编码者
  • 上次编码日期

MedDRA 词典列的编码:

  • 编码状态
  • 词典版本
  • LLTCD
  • LLT
  • PTCD
  • PT
  • HLTCD
  • HLT
  • HLGTCD
  • HLGT
  • SOCCD
  • SOC
  • 主路径
  • 上次编码者
  • 上次编码日期

本地实验室列:

说明
LBDTC 收集日期时间
LBDTC_RAW 收集日期时间的原始值
LBAGE 实验室年龄
LBAGE_UOM 实验室年龄单位
LBAGE_TRANSLATED 实验室年龄已转换的值
LBAGE_UOM_TRANSLATED 实验室年龄换算单位
LBTEST 实验室测试
LABMODIFIER 实验室修改器
LBORRES 实验室结果
DECODE_LBORRES 实验室结果单位/代码列表
TRANSLATED_LBORRES 实验结果已转换的值
UOMTRANSLATED_LBORRES 实验结果换算单位
LBORNRLO 正常范围下限
UOM_LBORNRLO 正常范围下限单位
TRANSLATED_LBORNRLO 正常范围下限已转换的值
UOMTRANSLATED_LBORNRLO 正常范围下限换算单位
LBORNRHI 正常范围上限
UOM_LBORNRHI 正常范围上限单位
TRANSLATED_LBORNRHI 正常范围上限已转换的值
UOMTRANSLATED_LBORNRHI 正常范围上限换算单位
LBOVRDNRLO 正常范围覆盖下限
UOM_LBOVRDNRLO 正常范围覆盖下限单位
TRANSLATED_LBOVRDNRLO 正常范围覆盖下限单位已转换的值
UOMTRANSLATED_LBOVRDNRLO 正常范围覆盖下限换算单位
LBOVRDNRHI 正常范围覆盖上限
UOM_LBOVRDNRHI 正常范围覆盖上限已转换的值
TRANSLATED_LBOVRDNRHI 正常范围覆盖上限已转换的值
UOMTRANSLATED_LBOVRDNRHI 正常范围覆盖上限换算单位
LBSTNRC 代码列表/文本值的正常值
DECODE_LBSTNRC 代码列表/文本值解码的正常值
LBOVRDNRC 代码列表/文本值的正常值覆盖
DECODE_LBOVRDNRC 代码列表/文本值解码的正常值覆盖
LBNRIND 正常范围指示符
LBCLSIG 临床意义

原始日期格式

对于日期和日期时间条目,“临床报告”包括日期的默认日期格式和 RawDate() 格式。RawDate() 格式会不经任何修改显示部分日期和时间。

记录的日期或日期时间 原始格式
1 27-10-2020 27-10-2020
2 ?-10-2020 UN-10-2020
3 ?-?-2020 UN-UNK-2020
4 27-10-2020 10:40 27-10-2020 10:40
5 27-10-2020 ? 27-10-2020 UN:UN
6 ?-10-2020 ? UN-10-2020 UN:UN
7 ?-?-2020 ? UN-UNK-2020 UN:UN

具有单位列的条目

对于单位类型的条目,“临床报告”包括已转换的名称和单位值的附加列。下表显示了“重量”条目包含的列,以千克为收集单位。

体重 重量_UOM 重量_已转换 重量_UOM_已转换
65 千克 143.3

编码列表解码

原始导出定义包括编码列表条目的解码值。这些值显示在原始条目列之后的新列中,条目名称后附加”_DECODE“。如果列标题重复,名称后跟数字,如 2、3 或 4。

例如,“signed_consent_form_DECODE_2”:

解码列

仅为新的导出定义和修改的现有定义添加 DECODE。DECODE 列与 itemtype 属性一起包含在清单文件中。

重复列处理

“临床报告”允许重复列,并将在 UI 中显示它们。

系统生成的列(例如附加了“_RAW”或“_UOM”的列)会自动附加“_2”,以防止在某些情况下发生重复列冲突。在导出列表 导出为 CSV 或 SAS 之前的导出转换期间,会发生这种情况。

对于用户定义的条目名称,“临床报告”尝试通过在前面附加条目组名称 来保留原始名称。生成 CSV 或 SAS 文件时,会发生这种情况。

导出数据包中的受限(设盲)数据

“临床报告”根据导出定义设盲(Blinded)属性确定在导出数据包中包含受限(设盲)数据。

如果选中未设盲(Unblinded)复选框,并且一个或多个导出列表 包含受限数据,则“临床报告”仅允许具有受限数据访问 权限的用户下载生成的导出数据包。

如果导出列表包含受限(设盲)数据,则只有在研究角色 授予受限数据访问 权限的情况下,“临床报告”才会导出受限数据。默认情况下,此权限分配给具有标准 CDMS Lead Data Manager(CDMS 首席数据管理员)研究角色的用户。

下面的列表描述了“临床报告”在为未设盲导出定义生成数据包时如何处理受限数据:

  • 源级限制:如果整个 受到限制(仅适用于第三方数据),则设盲导出数据包将不包含来自此源的任何数据。如果列表仅包含来自受限源的数据,则“临床报告”不会将该列表信息包含在导出数据包中。
  • 表单级别限制:如果表单 受到限制,则设盲的导出数据包将不包含该表单 中的任何数据。如果列表仅包含来自受限表单 的数据,则“临床报告”不会将该列表信息包含在导出数据包中。“临床报告”将不包括表单 的任何 @HDR、@Form 或 @ItemGroup 信息,并且表单 中的任何条目 也被排除在导出之外。
  • 条目级限制:如果条目 受到限制,则设盲导出数据包将不包含此条目。“临床报告”不会在任何列表中包含该条目 的任何列。如果列表在列表定义 中使用此条目 来派生另一列的值,则该列也将被排除。

创建导出定义

要创建导出定义,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击 + 创建 …(+ Create …) “创建(Create)”按钮

  3. 输入导出定义标题(Title)。这将显示在导出定义 列表的名称列中。
  4. 选择原始作为类型以创建该类型的导出定义。否则,请将此项保留设置为无(None)
  5. 可选:输入描述
  6. 单击下一步
  7. 可选:单击展开折叠以展开和折叠列表类别和导出定义。“临床报告”在可用列表(Available Listings)中按类别(Category)对列表进行分组,在导出定义中按导出定义 对列表进行分组。
  8. 列表(Listing)列表类别(Listing Category)可用列表拖放到已选择列表(Selected Listings)。还可以将导出定义拖放到已选择列表,以自动添加该定义中的每个列表。 将列表拖放到导出定义中

  9. 继续将列表拖放到已选择列表中,直到已选择列表包含导出定义 中所需的所有内容。
  10. 要从定义中移除列表,请单击移除(Remove))。虽然在创建导出定义 时无法移除原始类型导出的系统列表,但可以稍后使用修改列表操作将其移除。 移除列表

  11. 完成后,单击下一步(Next)
  12. 可选:输入导出列表的短标题(Short Title)。“临床报告”使用短标题 作为导出数据包中列表的文件名。
  13. 可选:编辑导出列表的标题
  14. 单击保存

现在可以生成并下载此导出定义 的导出数据包。

导出商品创建:将列表添加到导出定义会该列表的副本创建为导出列表。对导出列表执行的任何操作仅适用于该商品,而不适用于原始核心列表或自定义列表。

导出定义工作流

所有导出定义都以草稿 状态开始。定义中的每个列表也从草稿 开始。将所有列表标记为就绪 后,导出定义 将进入已发布 状态。如果在任何时候列表变得无效,则导出定义 将进入草稿 状态。要返回到已发布,必须移除或更新无效列表。如果任何列表返回到草稿 状态,则导出定义 也会返回到草稿 状态。

可以为处于草稿已发布 状态的导出定义 生成导出数据包。

查看状态标志以识别导出列表导出定义 的状态。状态标志显示在定义列表、定义中的列表以及列表页面上。

草稿状态标志

如何将列表标记为就绪

要将导出列表 标记为就绪

  1. 在“临床报告(Clinical Reporting)”>“导出”>“定义”中打开导出列表
  2. 验证列表是否可供使用。
  3. 单击状态切换开关中的就绪(Ready) “就绪”状态切换开关

通过单击状态切换开关中的草稿(Draft)将列表返回到草稿 状态。

导出更改检测

创建导出定义 时,它由导出列表 组成。这些导出列表是作为其创建来源的列表的快照。“父列表”是指用作创建导出列表来源的列表。当父列表的语法在上游更新时,在某些情况下,导出列表的列表定义 可能会与父列表的定义不同步。这可能导致导出数据包中的列表结构过时。例如,如果更新了公共自定义列表列表定义 语句,则从该父列表创建的任何导出列表 仍将反映创建导出列表 时使用的原始语句。

“临床报告”会在特定触发点检查导出定义的导出列表 的父列表是否有更改。当你或其他用户修改父列表时,临床报告会在导出定义 上显示更改指示符。然后,你可以选择查看列表定义 更改,并选择将导出列表 与父级同步。

必须是导出定义 的所有者或具有 Vault 所有者 安全配置文件才能将导出列表 与父级同步。

检测到的更改

“临床报告”仅检测同一环境中的更改,而不检测不同研究中的更改。

“临床报告”可检测以下更改:

  • 列表定义 的更新
  • 对研究设计的更改(例如,应用于原始类型导出定义中使用的核心列表 的新条目条目组
  • 当子列表用作导出列表 时,对父列表的列表定义 的更新

仅当核心列表 在具有原始 类型的导出定义中使用时,“临床报告”才会考虑应用于该列表的研究设计更改。

“临床报告”不会将对列表名称 或其他属性的更新视为更改。

“临床报告”会检查以下事件的更改:

  • 交换(成功导入后新数据可用时):“临床报告”会检查所有导出定义 中的更改。
  • 已保存对公共自定义列表视图列表定义 的更改:“临床报告”会检查包含已修改列表或视图的导出定义 中的更改。

查看列表定义更改

要查看更改,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击受影响(Impacted)筛选导出定义 列表,以仅显示受更改影响的定义。
  3. 单击以打开包含更改的导出定义(Export Definition)
  4. 单击受影响(Impacted)筛选导出列表 列表,以仅显示与其父级不同步的列表。

  5. 对于要查看的列表,请单击比较(Compare)。这将打开更改比较(Change Comparison)面板。

  6. 查看更改。
  7. 完成审查后,如果不想与父级同步,请单击关闭)关闭面板。

查看更改后,可以将列表与父级同步。

“更改比较”面板,显示对 adverse_event 表单的更改
“更改比较”面板,显示对 adverse_event 表单的更改

与父级同步

要将导出列表 与父级同步:

  1. 导航到受影响的导出定义
  2. 单击受影响(Impacted)筛选导出列表 列表,以仅显示与其父级不同步的列表。
  3. 对于要同步的列表,请单击比较
  4. 更改比较面板中,单击与父级同步(Sync with Parent)
  5. 在确认对话框中,单击确认(Confirm)

要将多个导出列表 与其父级同步,请执行以下操作:

  1. 导航到受影响的导出定义
  2. 单击受影响(Impacted)筛选导出列表 列表,以仅显示与其父级不同步的列表。
  3. 选中要同步的每个列表的导出列表(Export Listing)复选框。
  4. 可选:选中全选(Select All)复选框以选择当前页面上的所有列表。
  5. 单击与父级同步

  6. 在确认对话框中,单击确认(Confirm)

编辑导出定义

创建导出定义 后,可以稍后返回并修改包含哪些列表、编辑定义的属性以及重命名列表。

请注意,只能保存对已创建定义的更改。要对他人创建的列表进行更改,必须先创建一个副本,然后再进行更改。

Vault 所有者可以对所有用户创建的导出定义 进行更改。

如何重命名列表

可以在导出定义 中轻松重命名导出列表。在此处重命名列表仅会重命名导出列表,而不会重命名原始数据列表。

要重命名列表,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 打开导出定义
  3. 在“导出列表”表中,单击编辑(Edit))进入编辑模式。 “编辑”按钮

  4. 在文本字段中输入列表的新名称。 列表标题文本字段

  5. 单击查看(View))返回到“查看”模式并保存更改。 “查看”按钮

如何修改包含的列表

可以在导出定义 中添加和移除列表。

要修改包含的列表,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 操作(Actions)菜单(),选择选择列表(Select Listings) “修改列表”操作

  4. 可选:单击展开折叠以展开和折叠列表类别和导出定义。“临床报告”在可用列表(Available Listings)中按类别(Category)对列表进行分组,在导出定义中按导出定义 对列表进行分组。
  5. 列表(Listing)列表类别(Listing Category)可用列表拖放到已选择列表(Selected Listings)。还可以将导出定义拖放到已选择列表,以自动添加该定义中的每个列表。 将列表拖放到导出定义中

  6. 继续将列表拖放到已选择列表中,直到已选择列表包含导出定义 中所需的所有内容。
  7. 要从定义中移除列表,请单击移除(Remove))。 移除列表

  8. 单击下一步(Next)
  9. 可选:输入导出列表的短标题(Short Title)。“临床报告”使用短标题 作为导出数据包中列表的文件名。
  10. 可选:编辑导出列表的标题
  11. 点击 Save(保存)。

如何编辑导出定义属性

要编辑导出定义 的属性,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 导出定义)菜单中,选择属性(Properties) “属性”菜单条目

  4. 属性对话框中,单击 编辑 “查看”模式下的“属性”对话框

  5. 根据需要编辑属性。 “编辑”模式下的“属性”对话框

  6. 点击 Save(保存)。

复制导出定义

可以使用另存为 复制导出定义

要复制导出定义,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 导出定义)菜单中,选择另存为(Save As) “另存为”操作

  4. 可选:输入新导出定义的标题。默认情况下,标题 是原始定义的标题,并附加一个“2”。
  5. 可选:输入描述(Description)
  6. 点击 Save(保存)。

删除导出定义

请注意,只能删除已创建的导出定义

要删除导出定义,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 在列表中找到导出定义
  3. 导出)菜单中,选择删除(Delete)

生成 & 下载导出数据包

可以从任何现有导出定义 生成和下载导出数据包,作为一组 CSV 或 SAS 文件和一个清单文件。

  1. 导航到导出> 定义
  2. 在列表中找到导出定义
  3. 导出)菜单中,选择生成数据包(Generate Package) 生成数据包

  4. 选择 CSVSAS 作为导出格式。
  5. “临床报告”生成数据包后,单击下载)下载导出数据包(ZIP)。 下载导出数据包

导出数据包过期:导出数据包生成后,在三十(30)天内可供下载。30 天后,该数据包将过期,用户必须重新生成它才能下载。如果修改了导出数据包,则 30 天期限将重新开始。

示例清单文件

清单文件由系统生成的列表和一个核心列表组成,每个列表包含以下信息:

  • 用于创建文件的 CQL 的描述
  • 列及其描述列表
  • 对于条目,包含“名称”、“类型”、“条目类型”、“条目标签”、“源”和“表单”等属性
  • 对于编码列表条目,包含“编码”和“解码”

有关示例清单文件,请参见下文。

受限数据:如果导出数据包设盲,则清单文件将指示每个设盲条目的设盲属性。

  下载示例清单文件

计划定期导出

可以计划每天、每周或每月导出,并选择用户以便在导出数据包可用时发送通知。计划导出完成数据包的生成后,可以从导出> 定义下载数据包,或通过 FTP 将其传送到选择的位置。

要计划定期导出,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 导出定义)菜单中,选择属性(Properties)
  4. 单击编辑
  5. 如果已存在计划导出,请单击 添加计划(Add Schedule)。每个导出定义最多可以有五(5)个计划导出。“临床报告”不允许重复计划(匹配日期、时间、间隔和格式)。
  6. 选中计划(Schedule)复选框。
  7. 选择日期日期(Date)时间(Time)(UTC)。这是第一次导出的日期。然后,“临床报告”将在所选间隔(步骤 8)过去后生成未来的导出数据包。例如,如果选择“每周”和“2020 年 12 月 7 日凌晨 12:00”,则临床报告将在此时生成导出数据包,然后下一次导出将在“2020 年 12 月 14 日凌晨 12:00”(UTC)发生。
  8. 选择每天(Daily)每周(Weekly)每月(Monthly)作为间隔(Interval)
  9. 选择 CSVSAS 作为格式(Format)。这决定了“临床报告”为导出数据包生成的文件类型。
  10. 可选:选中传送(Delivery)复选框,然后选择 FTP 传送位置。有关创建传送目标的详细信息,请参见“创建 FTP 目标”。
  11. 点击 Save(保存)。

如何编辑计划导出

要编辑计划导出,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 导出定义)菜单中,选择属性(Properties)
  4. 单击编辑
  5. 根据需要对导出计划传送进行更改。
  6. 点击 Save(保存)。

如何停止计划导出

可以随时停止计划导出。在再次开始导出之前,导出不会再次发生。

要停止计划导出,请执行以下操作:

  1. 导航到导出> 定义
  2. 单击以打开导出定义
  3. 导出定义)菜单中,选择属性(Properties)
  4. 单击编辑
  5. 清除计划复选框。
  6. 点击 Save(保存)。

创建 FTP 连接

“临床报告”支持使用提供的 Vault FTP 服务器和第三方 FTP 服务器。如果计划使用所提供的 Vault FTP 服务器以外的位置,则必须已设置该服务器。

具有 Vault 所有者安全配置文件的用户可以从工具(Tools)> EDC 工具(EDC Tools)> FTP(FTPs)设置计划导出的目标

如果 Vault 使用自定义研究角色,则你的角色必须具有以下权限:

类型 权限标签 权限
“标准(Standard)”选项卡 “EDC 工具”选项卡 能够访问 EDC 工具选项卡。
功能权限 管理 FTP 能够在 EDC 工具中创建和编辑 FTP 连接

要设置 FTP 连接,请执行以下操作:

  1. 工具(Tools)> EDC 工具> FTP(FTPs)中导航到研究
  2. 单击 + 新建 FTP(+ New FTP)
  3. 输入 FTP 名称(FTP Name)。此名称将显示在导出定义的传送下拉菜单中(位于 EDC“临床报告”的“导出”部分)。 新建 FTP 连接 CDB

  4. 选择 CDB 作为类型,即使正在创建连接以将导出从“临床报告”发送到 Vault FTP 也一样。
  5. 输入用户名(User Name)。对于 Vault FTP 服务器,这是用于登录 Vault 的用户名,包括域名,主机在前面。例如,“verteopharma.veevavault.com+cordelia.hunter@verteopharma.com”。
  6. 输入密码(Password)
  7. 确认密码。
  8. 选择 FTP 方案(FTP Scheme)。如果要将导出从“临床报告”发送到 Vault FTP 服务器,请选择 FTPS
  9. 输入主机(Host)。对于 Vault FTP 服务器,这是 Vault 的 URL:{DNS}.veevavault.com。例如:“veepharm”是 veepharm.veevavault.com 中的 DNS。
  10. 输入端口(Port)
  11. 输入要将数据包传送到的目标路径(Destination Path)。如有必要,可以在 FTP 服务器中创建目标路径,然后再输入到此处。要在 Vault FTP 服务器中创建目标路径,用户需要 API 访问权限。
  12. 点击保存

有关连接字段详细信息以及如何编辑 FTP 记录的更多信息,请参见“从 EDC 工具连接到 FTP 服务器”。

订阅数据包通知

“临床报告”可以在导出数据包进入给定状态时发送电子邮件通知。与组织的用户管理员合作进行订阅

临床报告 - 导出

上次更新时间:24R1

本能视频演示如何从 EDC“临床报告”导出报告。